Высшим органом Общества является съезд, созываемый раз в 4 года. В перерывах между съездами руководит работой Общества избираемый на съезде Центральный совет во главе с президентом Общества.
Центральный совет Общества избирает из своего состава Президиум, который является органом оперативного управления Обществом в перерывах между заседаниями Центрального совета.
В состав Президиума входят Президент Общества, вице-президенты, ответственный секретарь, члены Президиума, а также ученый секретарь, возглавляющий административный аппарат Общества.
Аппарат Общества состоит из 2-х человек: ученого секретаря и бухгалтера.
Контроль за финансово-хозяйственной деятельностью Общества, осуществляет Ревизионная комиссия Общества, избираемая на заседании Съезда сроком на четыре года в количестве, определенном Съездом.
На V II Съезде Общества, прошедшем в августе 2016 г. в Петрозаводске на следующий срок (2016-2020 гг.) были избраны - президент Общества, члены Центрального совета и Ревизионной комиссии, Президиум общества и Бюро президиума Общества.